故障的判别：
基础：检查、寻找故障原因的基础是掌握故障判别的方法。掌握故障判别方法的基础是熟悉和了解仪器各部分的组成、作用、工作原理。
输入与输出：通常仪器的每个部分、部件、甚至零件都有它的输入和输出，输入一般是指该部分正常工作的前提，输出一般是指该部分所起的作用或功能。
举例：例如FID放大器，它的输入是FID检测器通过离子信号线传送过来的微电流信号、放大器的工作电源、以及放大器的调零电位器，它的输出是经过放大并送到二次仪表的电信号。判别FID放大器是否工作正常的方法是：
A.如果输入正常而输出不正常，则放大器故障。
B. 如果输入输出均正常，则放大器正常。
C.如果输入不正常，则放大器是否正常无法判定。
收集与积累：积极收集、认真记录、不断积累仪器各个部分工作正常与否的各种判别方法，并了解、熟悉、掌握、牢记这些故障判别方法。
仪器启动不正常
指接通电源后，仪器无反应或初始化不正常。
A.关机并拔下电源插头，检查电网电压以及接地线是否正常。
B.利用万用表检查主机保险丝、变压器及其连接件、电源开关及其连接件、以及其他连接线是否正常。
C.插上电源插头并重新开机，观察仪器是否已经正常。
D.如果启动正常，而初始化不正常，则根据提示进行相应的检查。
E.如果马达运转正常，而显示不正常，则检查键盘/显示部分是否正常。
F.如果显示正常，而马达运转不正常，则检查马达及其变压器、保险丝等是否正常。
G.必要时可拔去一些与初始化无关的部件插头，并进行观察。
H.如果初始化仍不正常，则基本上可确定是微机板故障。
温度控制不正常
指不升温或温度不稳定。
A.所有温度均不正常时，先检查电网电压及接地线是否正常。
B.所有温度均不稳定时，可降低柱箱温度，观察进样器和检测器的温度，如果正常，则是电网电压或接地线引起的故障。
C.如果电网电压和接地线正常，则通常是微机板故障，一般来说各路温控的铂电阻或加热丝同时损坏的可能性极下。
D.如果是某一路温控不正常，则检查该路温控的铂电阻、加热丝是否正常。
E.如果是柱箱温控不正常，还要检查相应的继电器、可控硅是否正常。
F.如果铂电阻、加热丝等均正常，则是微机板故障。
G.在上述检查过程中，要注意各零部件的接插件、连接线是否存在断路、短路、以及接触不良的现象。